La orina es una fuente viable para la prueba de BV. Esto se debe a que las mujeres embarazadas tienen que someterse inicialmente a pruebas de detección de leucocitos y glucosa en la orina. Algunos estudios no recolectan hisopos vaginales, por lo que esta orina de la primera evacuación, también conocida como FVU, puede ser el único material de origen en el que se puede investigar la VB.
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